据外媒Polygon报道，GameStop已经公布了3DS版《超级马里奥制造》游戏的官方包装封面。可能要让爱用 3DS掌机“裸眼3D”特性玩游戏的玩家失望了，封面中有一则明确的提示“仅支持2D游戏”，意味着该游戏将不支持掌机的3D显示特性，这也是首个不支持 3D特性的任天堂一方3DS游戏。
为了与WiiU版做出区分，3DS版的《马制造》也会缺失一些特性。比如在宣布这款游戏时，任天堂就说明玩家将无法通过互联网分享或上传自己创造的关卡地图，损失了一大乐趣。只能通过“擦身”和“面联”与附近好友们分享关卡。另外，游戏也无法通过输入关卡码来下载关卡，这意味着只能通过“百人团挑战”玩到网络上的新关卡，相较WiiU版本还是较大限制。
